审核完毕后，将毕业生档案存档，并发放档案存档证明或归档凭证给毕业生。调动时，档案室会将档案移交给新单位的档案室，新单位继续对档案进行管理与使用。需要注意的是，具体的档案处理程序可能会因单位、行业和地区的不同而有所差异，毕业生在就业过程中需要遵循单位的规定并与相关部门进行沟通，保证自己档案的顺利处理与管理。
重庆毕业生去机关、事业单位、国有企业就业的毕业生档案处理一般遵循以下程序：
1. 毕业生档案接收与归档：机关、事业单位、国有企业通常设立档案室或人事处，负责接收和归档毕业生档案。毕业生需要向所在学校或毕业院校的档案馆提出档案移交申请，并提供个人身份证明、居住证明和录取通知书等相关证明材料。
2. 档案审核与存档：就业单位的档案室或人事处会对接收的毕业生档案进行审核，确保档案的完整性和准确性。审核完毕后，将毕业生档案存档，并发放档案存档证明或归档凭证给毕业生。
3. 档案管理与使用：就业单位负责对毕业生档案进行管理和使用。毕业生档案包括学历证书、学位证书、成绩单、个人简历、家庭背景等信息，是评定毕业生绩效、晋升职位、提供相关证明等的重要依据。
4. 档案调动与归还：如果毕业生在就业单位内部发生职务调动或离职等情况，单位会对档案进行调动或归还。调动时，档案室会将档案移交给新单位的档案室，新单位继续对档案进行管理与使用。离职时，档案室会向离职毕业生发放档案离厂证明，毕业生可携带此证明到新单位或其他需要的地方使用自己的档案。
需要注意的是，具体的档案处理程序可能会因单位、行业和地区的不同而有所差异，毕业生在就业过程中需要遵循单位的规定并与相关部门进行沟通，保证自己档案的顺利处理与管理。